《揚州大學學報(高教研究版)》編輯部是在原江蘇農(nóng)學院、揚州師范學院、揚州工學院、江蘇商業(yè)專科學校等高校學報編輯部的基礎(chǔ)上，于1997年揚州大學合并辦學5周年之際成立。1997年創(chuàng)刊《揚州大學學報(人文社會科學版)》（雙月刊）、《揚州大學學報(高教研究版)》（季刊），2004年改為雙月刊；1998年創(chuàng)刊《揚州大學學報(自然科學版)》（季刊）；1999年將《江蘇農(nóng)學院學報》更名為《江蘇農(nóng)業(yè)研究》；2002年將《江蘇農(nóng)業(yè)研究》更名為《揚州大學學報(農(nóng)業(yè)與生命科學版)》（季刊）。

《揚州大學學報(高教研究版)》（雙月刊）創(chuàng)刊于1997年，是綜合性高等教育研究刊物，堅持理論聯(lián)系實際研究和探索高等教育改革與發(fā)展的各類問題，既發(fā)表高等教育改革與發(fā)展的理論性研究論文，也刊登具有普遍指導意義的高校教育教學改革的實踐經(jīng)驗，內(nèi)容覆蓋了高等教育的方方面面。本刊特別關(guān)注教育熱點，反映前沿學術(shù)動態(tài)?！陡咝Ｎ目茖W術(shù)文摘》、中國人大復印資料中心、《教育文摘周報》、《新華文摘》等都不同程度地轉(zhuǎn)載、摘引本刊所發(fā)論文。本刊為江蘇省期刊方陣優(yōu)秀期刊、第二屆全國優(yōu)秀社科學報。

《揚州大學學報（農(nóng)業(yè)與生命科學版）》（季刊）(原《江蘇農(nóng)業(yè)研究》、《江蘇農(nóng)學院學報》，2002年更為現(xiàn)名)是揚州大學主辦的綜合性農(nóng)業(yè)與生命科學學術(shù)期刊。本刊被列為國家科技部中國科技信息研究所《中國科技論文與引文數(shù)據(jù)庫》、中國科學院文獻情報中心《中國科學引文數(shù)據(jù)庫》統(tǒng)計源期刊、中國科技核心期刊、北大圖書館“全國中文核心期刊”，被聯(lián)合國糧農(nóng)組織AGRIS、英國CABI、動物學記錄（ZR）、美國DIALOG、化學文摘（CA）、波蘭哥白尼索引（IC）、國內(nèi)所有以“中國”名頭出版的農(nóng)業(yè)文摘類期刊和部分醫(yī)學文摘期刊及《中國生物學文摘》、《中國學術(shù)期刊(光盤版)》等作為一次文獻源期刊收錄。

《揚州大學學報（農(nóng)業(yè)與生命科學版）》主要刊登農(nóng)業(yè)科學、動物科學、動物醫(yī)學、生物技術(shù)、園藝、植物保護、食品科學、基礎(chǔ)醫(yī)學等學科的學術(shù)論文。主要欄目：農(nóng)學、動物科學、動物醫(yī)學、生物技術(shù)、園藝、植物保護、食品科學、基礎(chǔ)醫(yī)學等學科的學術(shù)論文。

《揚州大學學報（農(nóng)業(yè)與生命科學版）》獲全國中文核心期刊、第二屆江蘇省期刊方陣雙十佳期刊、全國高校自然科學學報一等獎。

《揚州大學學報（人文社會科學版）》（雙月刊）創(chuàng)刊于1997年，系綜合性人文社會科學學術(shù)刊物。該刊注重選題，努力反映人文社會科學最新研究成果；關(guān)注現(xiàn)實，積極為地方經(jīng)濟建設(shè)服務；體現(xiàn)特色，弘揚歷史文化名城優(yōu)勢。

《揚州大學學報（人文社會科學版）》該刊堅持學術(shù)性，強化理論性；堅持時代性，強化功能性；堅持現(xiàn)實性，強化特色性，致力實施精品戰(zhàn)略。該刊大力發(fā)揚學校人文社會科學學科優(yōu)勢和揚州歷史文化名城之地域特色，并精心打造“中國特色社會主義理論研究”、“蘇中地區(qū)經(jīng)濟社會發(fā)展研究”和“揚州文化研究”等特色欄目。該刊為中國人文社會科學核心期刊、中國期刊方陣雙效期刊、全國百強社科學報、中國人文社科學報核心期刊、全國中文核心期刊。